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天门山隆起开始于燕山运动，再经喜马拉雅山造山运动，山体剧烈抬升千米以上，周围被断层节理深深切割，加上长期风雨侵蚀的岩溶作用，造就成嵯峨高峙、凌空独尊的喀斯特台型地貌其。山顶相对平坦，保存着完整的原始次生林，有着很多极为珍贵和独特的植物品种，森林覆盖率达90%。