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大蒜细胞中的含有较多的含硫类生物活性物质，这些含硫化物在蒜酶的作用下，可生成硫代亚磺酸脂、丙烯基硫代亚磺酸脂、烯丙基硫代亚磺酸脂等大蒜色素的物质前身。这些物质经过一系列的反应进而生成大蒜色素。通常，最初形成的为蓝色素有叫蒜兰素；蓝色素不稳定逐渐转化为黄色素，有叫蒜黄素；两者共存使蒜呈现绿色，最后蓝色素全部转化为黄色素。这种绿色素是一种天然的花青素类色素，它不是很稳定，现在很多研究发现，大蒜的这种绿色素有很强的抗氧化能力，是一种优质的抗氧化剂。所以，食用绿色的大蒜不但无毒，还有强身健体的作用。