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1996年之后，大学不再包分配。1997年由国家教委发布《普通高等学校毕业生就业工作暂行规定》，进一步规定自主择业下的工作程序，明确了政府部门、高校、毕业生的职责、权利、义务，1998年，首批并轨改革后招收的大学生毕业进入社会，至此除少数定向招生 、民族生在国家规定范围内就业，绝大多数毕业生实现了自主就业。

到2000年，包分配制度正式告别历史。教育部要求从2000年起停止使用《全国普通高等学校毕业生就业派遣报到证》和《全国毕业研究生就业派遣报到证》，启用《全国普通高等学校本专科毕业生就业报到证》和《全国毕业研究生就业报到证》。