1、地理位置不同

海口站即海口火车站，是粤海铁路海口轮渡站点。海口站位于海口市秀英区粤海大道，离海边不到1公里。

海口东站位于海南省海口市琼山区的火车客运站，是海南东环高铁的其中一个车站，与美兰站、城西火车站相邻接。与环岛高铁实现无缝对接。

2、主要线路不同

海口站主要线路：粤海铁路、海南东环铁路。

海口东站主要线路：海南环岛铁路。

目前，海口有两个火车站，分别是海口东站和海口站。海口东站位于琼山区凤翔西路，海口火车站的地址是秀英区粤海大道1号。

区别如下：

1、车站等级的区别：海口站为耳机站，海口东站为一等站，美兰站为客运站无等级。

2、停靠站的区别：海口站是综合型车站，停靠客车，货车，动车，海口东站停靠动车，美兰站是地下火车站，停靠客运车。

3、站台规模的区别：海口站四个硬座候车室和一个软座候车室。已铺设9条铁轨，其中，6条为货运，以满足货物进出岛的需要，海口东站是东环高铁（动车）与公交的枢纽站，美兰机场站是海南东环铁路的一个客运站。美兰机场车站属于地下车站，分为上下两层。

4、所属路线的区别：海口站是粤海线路，海口东站是海南东环线路，美兰站是，机场线路。

5、始建的区别：海口站2004年12月5日，海口站正式办理客运业务，海口东站于2009年7月30日动工，2008年5月2日，东环铁路美兰机场站正式开工。

位置如下：

1、海口站就是海口火车站，在秀英港，是所有进出岛的火车停靠的车站，也有少量动车。海口站去海口东站之间可以坐公交换乘。

2、海口东站在琼山区凤翔路，是专为城际列车要求设计的，是海口和三亚之间的动车的主要停靠站。

3、美兰站机场高铁站是一个中途站。去海口的美兰机场，高铁直到这里下车。

参考资料来源：百度百科-海口站

参考资料来源：百度百科-海口东站

参考资料来源：百度百科-美兰站