有危害，在密闭的空调房间内点蚊香会对人体有较大危害。蚊香燃烧的烟里含有4类对人体有害的物质，即超细微粒-烟尘（直径小于2.5微米的颗粒物质）、多环芳香烃、羰基化合物和苯。同时，除了这4类明显的有害物质外，蚊香中还有大量的有机填料、黏合剂、染料和其他添加剂，才能使蚊香可以无焰闷烧。普通用的蚊香本身是对人体健康有一定程度的损害的。而房间内在开空调的情况下是密闭门窗，且空调的风机电机持续驱动房间内空气进行流动的，在这种密闭环境中点蚊香，等于就是加速了蚊香燃烧释放的物质在房间内扩散的速度，也就加速了人对蚊香燃烧所产生的物质的接触，增大了蚊香燃烧所产生的有害物质对人体的损害几率和程度。而点蚊香只是把蚊子熏晕。
建议如果要灭蚊使用蚊香的时候，不开启空调，只需要关闭门窗，在房间内点上蚊香，整个房间熏个30分钟以上，期间人离开房间，待过一定时间之后再回到房间并打开门窗通风换气即可，亦或者使用环保的电蚊拍。