１、强调主体不同：人化自然强调人化，主体是人；自在自然强调自然的力量，主体为自然，没有人的参与。　

２、强调人与自然的关系不同：人化自然强调在遵循自然规律，不破坏自然的前提下，人与自然和谐（概括为：虽由人作，宛自天开）；自在自然完全是自然各种自然要素相互作用的结果，是原生态的。

３、概念不同：人化自然是人类活动改变了的自然界，也相当于人类社会；自在自然指的是人类世界产生前的自然界或者是人类活动尚未深入到的自然界。