1、东林党人排除异己做法的讨厌，东林党在明末最大的对手就是魏忠贤的阉党了，双方都两败俱伤，但是东林党掌控着社会舆论优势，对于阉党在宣传上有着先天优势。但是东林党到后期几乎对舆论的把控失控的，斗倒魏忠贤后，凡是非东林的人都被扣上阉党的帽子，甚至遭受清算，袁崇焕都被推波助澜了，最后竟然自己内斗起来互相揭底，给后人的感觉就是极度虚伪，但是他们又不断说自己正人君子。

2、东林党人代表江南地主和工商阶级的利益，这群人要求别人要怎么忠君爱国，要求别人支持国家大义。但是轮到自己出血出力时却判若两人，在明王朝倾覆之际，将小团体的利益置于国家利益之上，代表问题就是反对税收，对于政府征收矿税来延续国家财政时，东林党人为首的江南工商阶层抗税并骂朝廷苛政。作为国家的主流阶级他们这个时候完全忘记了之前要求别人时提出的：道德济世。

3、东林党人本身的问题就是大部分东林党人的志大才疏，以道德卫士自居，对他人进行道德绑架。