有三个特点，一是均为蛋白质、二是具有选择性、三是具有理化特征。

1、均为蛋白质。大多数外毒素蛋白由Ａ、Ｂ两个亚单位组成。Ａ亚单位是毒素的毒性部分，决定毒素的致病作用。Ｂ亚单位无致病作用，是介导外毒素分子与宿主细胞结合的部分，具有对靶细胞的亲和性。

2、选择性。外毒素对组织器官具有选择作用，通过与特定靶组织器官的受体结合，直接或进入细胞后引起特征性的病变。

3、理化特性。绝大多数外毒素不耐热，对化学因素也不稳定。

外毒素是细菌毒素的一种。