他们其实是一样的涉及内容但不是一本书，是不同时期不同人物的不同书籍。

《水经注》是我国第一部以记载河道水系为主的综合性地理著作，是郦道元毕一生之功而成的中国历史地理学鸿著，凡40卷，引诸史、地记、杂著数百种及亲身考察所得，详见水道千余条，叙其地理变迁沿革，旁及城郭、风俗、土产、人物等，是继《山海经》、《禹贡》之后中国地理学的经典名作。

《水经注校证》是后人陈桥驿根据原著《水经注》的内容，进行复核、修订、即所谓“校异文、辨正误、补异文、考原委”等编写而成。陈桥驿先生是我国著名历史地理学家、郦学专家，他致力于《水经注》研究60余年，出版郦学著述24种，成就斐然。《水经注校证》以武英殿聚珍本为底本,参校其他35种版本,并利用120余种地方志和300余种其他文献,吸收中外学术成果,进行校勘标点和校证。比之1999年出版的《水经注校释》一书，本书主要吸收增加了三种资料。一是《胡适手稿》中的相关内容；二是《郦学札记》，即作者有关《水经注》的读书笔记；三是熊会贞、杨守敬合著的《水经注疏》，《水经注校证》一书凝聚了作者毕生研究心血，代表了水经注研究当代最高整理研究水平。