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细胞质里含有一个近似球形的细胞核（Nucleus），是由更加黏稠的物质构成的。细胞核通常位于细胞的中央，成熟的植物细胞的细胞核，往往被中央液泡推挤到细胞的边缘。细胞核中有一种物质，易被洋红、苏木精、甲基绿、龙胆紫溶液等碱性染料染成深色，叫做染色质（Chromatin），生物体用于传种接代的物质即遗传物质，就在染色质上，当细胞进行有丝分裂时，染色质在分裂间期螺旋缠绕成染色体，多数细胞只有一个细胞核，有些细胞含有两个或多个细胞核，如肌细胞、肝细胞等，