桃子软腐病主要危害桃树的果实。这种病害通常会在果实上形成黑褐色的软腐斑点，导致果实变软、变烂，失去食用价值。这不仅会影响果实的质量和产量，还会使果实上的病菌扩散到其他部位，加剧病害的蔓延。

桃子软腐病也会危害桃树的枝干。这种病害会在枝干上形成溃疡，导致枝干枯萎、死亡。如果不及时处理，这些感染了软腐病的枝干很可能变成桃树的传染源，使病害更加严重。

桃子软腐病还会危害桃树的根系。由于病菌的侵害，桃树的根系会出现腐烂现象，导致树势衰弱、生长缓慢，严重影响产量和品质。