自制酸奶需要注意的是选择牛奶时，要选择全脂常温的纯牛奶，最好是超高温灭菌UHT纯牛奶，以及收到菌种时，要立刻放在冰箱冷冻层保存，否则不可食用，并且在加菌粉时要边遍洒边搅拌，必须要搅拌均匀。

在做酸奶时，卫生也是一大重点，酸奶机的内胆要用洗洁剂以及温水清洗干净，并且用百洁布擦拭干净，不得有油以及洗洁剂的残留。其次，在发酵酸奶时，并不是时间越长越好，最佳时间是在室温二十六度左右的前提下，用酸奶机将牛奶加热到四十度左右，持续保温发酵六小时最为合适。

最后要注意的是，酸奶发酵完成之后，要立即放进冰箱冷藏储存，否则酸奶会持续发酵，并且在发酵的过程中，千万不要打开盖子，否则，将空气带入进酸奶机会影响到酸奶的发酵，很容易导致酸奶变质。